Sejak awal 1990-an sampai saat ini, UII telah mengembangkan kampus terpadu yang terletak di Kabupaten Sleman. UII memiliki 8 fakultas dengan berbagai 5 program D3, 22 program sarjana, 3 program profesi, 8 program magister, dan 4 program doktor, serta lembaga-lembaga pendukung.
Pada 2015 Kemenristekdikti mengumumkan UII masuk dalam pemeringkatan 10 perguruan tinggi terbaik di Indonesia berdasarkan kualitas manajemen. Selanjutnya pada 2016, UII menerima penghargaan tiga bintang dari QS Star dengan skor tertinggi untuk Perguruan Tinggi Swasta (PTS) di Indonesia, serta peringkat pertama PTS di Bidang Kinerja Penelitian oleh Ristekdikti.
3. Universitas Atma Jaya Yogyakarta
Universitas Atma Jaya Yogyakarta lahir pada 27 September 1965 berada di peringkat ke-28 versi Webometrics.info. Lembaga pendidikan tinggi swasta yang didirikan oleh kaum awam Katolik dan dikelola oleh Yayasan Slamet Rijadi – Yogyakarta, di bawah lindungan Santo Albertus Magnus ini di urutan ke 3.396 dunia.
Baca Juga:10 Universitas Swasta Jogja Terkenal: UAD, UKDW hingga Atma Jaya
Dikutip uajy.ac.id, Universitas Atma Jaya Yogyakarta lahir dengan tujan untuk ikut serta mencerdaskan kehidupan bangsa melalui pendidikan yang berdimensi lokal serta berorientasi global. Sejak 31 Agustus 1973 Universitas Katolik Indonesia Atma Jaya Cabang Yogyakarta melepaskan diri dari Universitas Katolik Indonesia Atmajaya di Jakarta, dan berdiri sendiri sebagai Universitas Atma Jaya Yogyakarta.
Nama Atma Jaya diambil dari Bahasa Sansekerta. Atma berarti jiwa, Jaya berarti unggul. Artinya, Atma Jaya berarti jiwa yang unggul. Cita-cita UAJY sejak semula adalah menyelenggarakan pendidikan tinggi dengan keunggulan pada bidang akademik dan pendidikan nilai-nilai moral yang tinggi. Semua program studi S1 dan S2 telah terakreditasi BAN-PT.
Pada Webometrics.info, UAD berada di peringkat ke-31 secara nasional dan ke-3.540 di dunia. UAD merupakan sebuah perguruan tinggi swasta yang berdiri di Yogyakarta yang didirikan pada tanggal 19 Desember 1994.
Dikutip uad.ac.id, UAD adalah pengembangan dari IKIP Muhammadiyah Yogyakarta yang merupakan pengembangan FKIP Muhammadiyah Cabang Jakarta. Universitas ini berdiri pada 18 November 1960. FKIP Muhammadiyah merupakan kelanjutan kursus BI Muhammadiyah di Yogyakarta yang didirikan pada 1957. Pada waktu itu kursus BI memiliki jurusan Ilmu Mendidik, Civic Hukum, dan Ekonomi.
Baca Juga:Pakar UMY: Layanan Kesehatan Mental di Indonesia Belum Merata
Pada tanggal 19 Desember 1994 ditetapkan IKIP Muhammadiyah Yogyakarta beralih fungsi menjadi Universitas Ahmad Dahlan. UAD telah memiliki sebuah saluran televisi, yaitu Televisi Universitas Ahmad Dahlan (TV UAD). Inilah yang menjadi keunggulan UAD di dunia broadcasting.
