Belakangan, Gus Miftah memutuskan untuk mengundurkan diri dari jabatannya di Kabinet Merah Putih sebagai Utusan Khusus Presiden karena sebagai bentuk tanggung jawab dan kecintaannya kepada Presiden Prabowo.
Gus Miftah sempat terisak ketika menyampaikan keputusannya mengundurkan diri di Ponpes Ora Aji.
Tercatat, Gus Miftah hanya bertugas selama 46 hari sebagai Utusan Khusus Presiden bidang Kerukunan Beragama dan Pembinaan Sarana Keagamaan.