Polemik pembangunannya pun menjadi sorotan publik, muncul warga yang pro dan kontra terhadap pembangunan tersebut. Hingga akhirnya, pembangunan bandara Rp12 triliun itu rampung dan diresmikan Jokowi.
Saat ini Bandara YIA di Kulon Progo ini terus dikembangkan. Usai beroperasi, PT KAI bersama Angkasa Pura meluncurkan KA Bandara sebagai transportasi terintegrasi yang memudahkan para penumpang dan wisatawan untuk bertandang ke DIY dan sekitarnya.